El Programa Institucional de Emergencias (PIE) inicia labores en 1994, adscrito a la Gerencia Administrativa. Es oficializado por acuerdo de Junta Directiva No. 7389 el 18 de noviembre de 1999, en su articulo 18, e incorporado al organigrama como órgano asesor de las gerencias.
Fue reconocido por la Dirección de Desarrollo Organizacional en el año 2000, lo que permitió la creación de un código y la partida presupuestaria correspondiente.
En febrero de 1999 se presentó el primer Plan Estratégico de trabajo continuando labores de gestión de riesgo y atención de emergencias institucionales de la Caja Costarricense del Seguro Social.